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第九屆功能磁共振影像(fMRI)培訓班現(xiàn)正接受報名

發(fā)布時間:2013-09-11瀏覽數(shù):2591

各位新老學員:
大家好!
 
      美德醫(yī)療在大家的支持和鼓勵下,不斷推出新的培訓課程,多年來連續(xù)舉辦各類fMRI培訓班,至今已經(jīng)第九屆了,為各學科人才在科研工作中提供學習和交流等資源共享平臺,得到了業(yè)內(nèi)人士的高度肯定,fMRI的培訓班已經(jīng)日趨常規(guī)和系統(tǒng)化,每年都會舉辦至少兩期。其中我們很多學員都學有所成,取得了驕人的成績,我們也倍感欣慰。經(jīng)過和學員以及幾位授課專家總結(jié)經(jīng)驗,以后的培訓將以專題為目標,深入細致講解各種技術(shù)的原理和應(yīng)用。本次培訓班將以深入學習靜息態(tài)fMRI技術(shù)和多模態(tài)融合方法,聘請研究領(lǐng)域最優(yōu)秀的講師團隊,培訓班將保留往屆非常受歡迎的數(shù)據(jù)處理解析,科研思路講解,學員的互動討論環(huán)節(jié),使得課程更加實用,也為學員中科研人才和臨床醫(yī)生合作搭建橋梁,希望我們在金秋時節(jié)一起收獲新的知識。
 
現(xiàn)就報名有關(guān)事宜說明如下:
 
1. 培訓班報到時間為11月21日下午6:00前,晚上開始上課,精彩不容錯過。
 
2. 為便于會務(wù)安排,報名時請按照回執(zhí)表認真填寫并email給會務(wù)組。由于報名名額有限,請學員盡早報名,盡量用電匯的方式提前轉(zhuǎn)帳確認,現(xiàn)場不能刷卡繳費。
 
3.  希望參加發(fā)言討論的學員請盡快報名,將研究摘要以poster形式發(fā)給會務(wù)組。所有墻報經(jīng)專家評選出口頭報告5-10個,口頭報告之后,同時參加poster交流。具體內(nèi)容可以是已經(jīng)發(fā)表的文章、未發(fā)表的初步研究結(jié)果,甚至僅僅是研究設(shè)計。墻報寬度90厘米,高度120厘米。墻報交流過程中,所有授課專家全程參與,以保證專家與學員、學員與學員的充分交流。
 
 
附:數(shù)據(jù)處理軟件操作培訓班調(diào)研表:
 
      美德醫(yī)療將聯(lián)手多個研究單位,并依托香港中文大學深圳研究院醫(yī)學影像研究培訓中心,建立數(shù)據(jù)處理培訓中心,配置超高速處理工作站,用于多種fMRI技術(shù)所需要的軟件上機操作培訓。我們將不定期根據(jù)報名和需求情況開辦實操培訓,聘請專業(yè)的講師和博士研究生團隊按步驟演示軟件的運行,為了了解大家對各軟件學習的需求,我們特列出了可能需要學習的各種軟件,希望先做一個摸底調(diào)查,根據(jù)大家的需求權(quán)重高低開設(shè)課程。請各位學員認真填寫并email給會務(wù)組。
 
感謝大家對美德醫(yī)療的支持,我們將一如既往地堅持培訓工作,為大家?guī)沓掷m(xù)學習的機會和專家交流的良好平臺。
 
順祝大家中秋國慶節(jié)日快樂,合家團圓!
 
美德醫(yī)療
 
2013年9月






第九屆功能磁共振影像(fMRI)培訓班
              --- 靜息態(tài)fMRI技術(shù)及應(yīng)用專題
  中國·北京 2013.11.21 – 11.24

主辦單位:
 北京中科美德醫(yī)療信息科技有限公司
                   深圳市美德醫(yī)療電子技術(shù)有限公司
                                      
講師單位:   北京師范大學認知神經(jīng)科學與學習國家重點實驗室
                   杭州師范大學認知與腦疾病研究中心
                   中國科學院心理研究所
                   臺灣長庚大學醫(yī)學院
                   耶魯大學醫(yī)學院
 
1.    研討會簡介
      功能磁共振影像(fMRI)近年來的發(fā)展日新月異,已成為研究認知和臨床腦疾病的重要技術(shù)。靜息態(tài)功能磁共振成像(Resting-State fMRI)作為研究靜息下人腦自發(fā)腦功能活動的重要手段,近十年來得到了快速發(fā)展,特別是與之相關(guān)的數(shù)據(jù)分析方法如研究腦區(qū)局部特征的方法(ReHo, ALFF等)和研究腦區(qū)之間關(guān)系的網(wǎng)絡(luò)分析(Brain network Analysis)等。利用靜息態(tài)fMRI技術(shù),研究人員能夠獲取腦局部活動、功能連接、腦網(wǎng)絡(luò)屬性等多維度信息,為全面深入了解認知的神經(jīng)機制以及神經(jīng)精神疾病如精神分裂癥、老年癡呆癥、兒童注意缺陷多動障礙、癲癇、中風、腦外傷等臨床問題的神經(jīng)生理病理學機制提供了重要幫助。
      本次培訓班的宗旨是讓學員們能夠深入了解靜息態(tài)fMRI技術(shù)在國際、國內(nèi)的最新進展,掌握靜息fMRI的基本原理,了解相關(guān)的實驗設(shè)計、影像采集、數(shù)據(jù)處理、結(jié)果解釋等方面的知識, 為做出高水平的研究工作提供幫助。本培訓班將結(jié)合實例,重點介紹靜息態(tài)fMRI在認知研究和臨床實驗設(shè)計所需要的基本要素以及數(shù)據(jù)處理相關(guān)的統(tǒng)計方法。此外,培訓班還將講授靜息態(tài)fMRI論文寫作中的技巧和注意事項。
本次培訓班主要包含三方面內(nèi)容:
  • 由諸多著名專家學者介紹靜息fMRI新技術(shù)的基本原理、實驗設(shè)計、數(shù)據(jù)分析的最新進展。專家學者結(jié)合自身研究方向, 講解靜息fMRI在認知和臨床腦疾病研究中的應(yīng)用。
 
  • 延續(xù)以往培訓中備受歡迎的“Panel Discussion”環(huán)節(jié),全體講師齊聚講臺,針對靜息態(tài)fMRI領(lǐng)域中的熱點話題以及學員現(xiàn)場的提問,闡述各自不同觀點和經(jīng)驗,與大家分享科研心得。
 
  • 由專家學者講解靜息態(tài)fMRI科學論文的寫作。專家學者將會用親身經(jīng)驗解悟靜息態(tài)fMRI相關(guān)論文寫作的要點和難點, 并且結(jié)合自己已發(fā)表的論文作為范例,講解從起草到發(fā)表的具體過程。
 
  • 由學員以墻報或口頭的形式報告自己的研究方向(自愿參與),并由專家學者做點評。對該活動感興趣的學員,請?zhí)崆?5天將摘要以poster形式發(fā)給會務(wù)組。所有墻報經(jīng)專家評選出口頭報告2-3個,口頭報告之后,同時參加poster交流。具體內(nèi)容可以是已經(jīng)發(fā)表的文章、未發(fā)表的初步研究結(jié)果,甚至僅僅是研究設(shè)計。墻報寬度90厘米,高度120厘米。墻報交流過程中,所有授課專家全程參與,以保證充分的專家與學員、學員與學員的交流。此次培訓班側(cè)重臨床應(yīng)用,面向所有與腦疾病相關(guān)的臨床醫(yī)生以及認知神經(jīng)科學領(lǐng)域的相關(guān)研究人員,大家一定會獲益匪淺。
         在金秋時節(jié),在首都北京,我們熱忱期待您的光臨!
 
 
2.    授課專家
      臧玉峰,1984年于河北醫(yī)學院醫(yī)學系獲醫(yī)學學士學位、1991年于天津醫(yī)學院獲神經(jīng)外科學碩士學位、2002年于北京大學獲精神病學博士學位?,F(xiàn)任杭州師范大學認知與腦疾病研究中心教授。曾從事神經(jīng)外科工作十余年。近十幾年來一直從事靜息態(tài)功能磁共振計算方法及其在腦疾病的應(yīng)用研究。合作發(fā)表英文論文約90多篇,被SCI引用共3000多次(其中,2012年全年被引用約1000次)。與同事一道,提出了“局部一致性”(Zang et al., 2004, NeuroImage)和“低頻振幅”(Zang et al., 2007, Brain Dev)方法。帶領(lǐng)研究組開發(fā)了針對靜息態(tài)fMRI的數(shù)據(jù)處理軟件包REST和“流水線”式軟件包DPARSF。國際上引用這些軟件的英語論文約200篇。目前帶領(lǐng)的研究團隊包括張寒研究員、廖偉研究員、劉東強副研究員、廖旭紅副研究員等人,并與多家單位合作,開展靜息態(tài)fMRI方法學及其在腦疾病的應(yīng)用研究,如神經(jīng)反饋、癲癇、術(shù)前術(shù)中功能定位、DBS和TMS靶點定位、注意缺陷多動障礙、自發(fā)記憶鞏固與記憶障礙等。
 
      賀永,博士,國家杰出青年基金獲得者,北京師范大學認知神經(jīng)科學與學習國家重點實驗室研究員(PI),兼任IDG/麥戈文腦科學研究所研究員(PI),博士生導師。目前兼任山東大學、首都醫(yī)科大學等國內(nèi)外10余所高校、醫(yī)院、省部級實驗室兼職教授、專家、學術(shù)委員等。2005年在中科院自動化研究所獲博士學位。2005年至2007年在加拿大麥基爾(McGill)大學蒙特利爾神經(jīng)學研究所從事博士后研究。2008年回國在北京師范大學認知神經(jīng)科學與學習國家重點實驗室工作,擔任“計算神經(jīng)影像與人腦連接組”團隊學術(shù)帶頭人。先后主持國家杰出青年基金、國家自然科學基金重點項目、北京市自然科學基金等多項國家和省部級課題?,F(xiàn)任國際期刊《Frontiers in Human Neuroscience》、《PLoS ONE》和《Brain Connectivity》編委,美國阿爾茨海默病協(xié)會、荷蘭阿爾茨海默病協(xié)會、法國國家研究署、英國哈德溫博士人道研究基金會、國家自然科學基金委等10余個國內(nèi)外機構(gòu)的基金評審專家,以及Am J Psychiatry, Ann Neurol, Brain, J Neurosci等30余個國際期刊論文評審人。在PNAS, Brain, Biol Psychiatry, J Neurosci等本領(lǐng)域主流期刊共發(fā)表SCI論文105篇,SCI總引用3400余次,H指數(shù)28。2009年和2011年獲Scopus青年科學家獎(生命科學領(lǐng)域)和國際心理科學聯(lián)合會APS Observer新星獎。帶領(lǐng)團隊開發(fā)腦網(wǎng)絡(luò)分析和可視化軟件包Gretna和BrainNet Viewer。主要研究領(lǐng)域為計算神經(jīng)影像與人腦連接組學。詳細介紹,請參考http://psychbrain.bnu.edu.cn/teachcms/heyong.htm。
 
     畢彥超,北京師范大學認知神經(jīng)科學與學習國家重點實驗室、IDG/McGovern Institute for Brain Research 研究員、團隊帶頭人(Principal Investigator)。于2006年獲哈佛大學心理學系腦、認知、行為專業(yè)博士學位。作為首席科學家主持973計劃青年項目,是國家自然科學基金委優(yōu)秀青年基金獲得者,擔任北京神經(jīng)科學學會理事。主要圍繞語言和語義記憶的認知神經(jīng)基礎(chǔ)進行研究,作為通訊作者在Brain, Journal of Neuroscience、Cortex、NeuroImage、Brain and Language等國際心理學和神經(jīng)心理學雜志發(fā)表多篇論文。曾獲Sackler Scholars Programme in Psychobiology獎項和國際心理科學聯(lián)合會新星獎。
 
      劉鶴齡,教授,博士,臺灣長庚大學醫(yī)學院,醫(yī)學影像暨放射科學系教授,臺灣長庚醫(yī)院放射診療部特聘顧問。畢業(yè)于臺灣清華大學物理系,2000年于美國德州大學獲醫(yī)學物理博士,從事血液灌注之計算方法與fMRI的技術(shù)研究。完成博士學位后返回臺灣工作,與臨床放射科、神經(jīng)內(nèi)外科、復建科、精神科、眼科及中醫(yī)多位醫(yī)師專家合作,進行磁共振臨床研究課題,并持續(xù)與大陸及香港多位杰出心理學家合作,在神經(jīng)科學領(lǐng)域有新的探索。目前共發(fā)表有70余篇SCI論文,并為NeuroImage, Human Brain Mapping, MRM, JMRI等知名期刊審稿。2004年獲RSNA/AAPM資助至德州安德森癌癥中心完成一年臨床影像物理Residency訓練,并通過考試獲美國放射??疲ˋBR)認可診斷醫(yī)學物理師資格。2010年至加州大學圣地亞哥分校Center for Functional MRI半年,研習最新的ASL技術(shù),期望將之推廣于臨床研究。
 
      王菲,醫(yī)學博士,耶魯大學醫(yī)學院精神科助理教授。主要研究興趣為多模態(tài)影像學在重性精神疾病中的應(yīng)用。在精神醫(yī)學,神經(jīng)科學以及影像醫(yī)學雜志(American Journal of Psychiatry, Biological Psychiatry, Brain等)發(fā)表SCI論文近50篇。先后獲得NIMH職業(yè)發(fā)展獎 K01, 兩次NARSAD青年研究員獎, Klingenstein Fundation 青年研究員獎。為20多個國際雜志審稿,并參加中國國家自然科學基金委、美國National Institute of Healthy、以及英國Medical Research Council等基金的評審。
 
      左西年,博士(應(yīng)用數(shù)學),中國科學院心理研究所研究員,博士生導師,中科院“百人計劃”入選者,國際“千人功能連接組計劃”方法學支撐,國際“神經(jīng)影像數(shù)據(jù)聯(lián)盟”咨詢團成員。主要研究領(lǐng)域為人腦功能連接組學及其應(yīng)用,主要研究方向:1)靜息態(tài)功能磁共振計算方法及其重測信度,2)人腦功能連接組發(fā)展軌線。最近五年在國際學術(shù)期刊發(fā)表學術(shù)論文50篇,其中13篇為第一和/或通訊作者,13篇發(fā)表在神經(jīng)影像方法學領(lǐng)域國際最高水平的雜志NeuroImage上,被引1178次(他引1076次),年均引用236次,H指數(shù)18。第16屆國際人腦成像年會做大會口頭報告(2010),獲NeuroImage解剖與生理編輯選擇獎(2010),受邀在劍橋大學“網(wǎng)絡(luò)與連接組論壇”做1小時報告(2012)?,F(xiàn)任國際期刊《公共科學圖書館-綜合》(PLoS ONE)學術(shù)編委和統(tǒng)計編委、《腦成像方法前沿》(Frontiers in Brain Imaging Methods)評審編委;NeuroImage, Human Brain Mapping, Journal of Neuroscience, Archives of General (JAMA) Psychiatry, American Journal of Psychiatry, Biological Psychiatry,Neuroscience & Biobehavorial Reviews等30余個專業(yè)期刊審稿人;荷蘭Marie Curie國際基金、A-star新加坡國立大學-美國杜克大學聯(lián)合基金評審專家、英國醫(yī)學研究理事會(MRC)基金評審專家;目前主持國家自然科學基金面上項目、國際重大合作項目、中國科學院重點部署項目和中國科學院儀器設(shè)備功能開發(fā)技術(shù)創(chuàng)新項目各一項。詳細信息請參見課題組網(wǎng)站:http://lfcd.psych.ac.cn/index.html 和http://scholar.google.com/citations?user=a3-gVGMAAAAJ&hl=en
 
      龔高浪,國家自然科學優(yōu)秀青年基金獲得者,北京師范大學認知神經(jīng)科學與學習國家重點實驗室研究員,博士生導師。2006年畢業(yè)于中科院自動化所,獲博士學位,2006-2010赴加拿大Alberta大學、Mcgill大學從事博士后研究,2011年至今在北師大認知神經(jīng)科學與學習國家重點實驗室工作。榮獲scopus“青年科學之星”(生命領(lǐng)域),入選北京市科技新星計劃。主要從事基于結(jié)構(gòu)與彌散磁共振神經(jīng)影像的活體腦連接與腦網(wǎng)絡(luò)研究,已在本領(lǐng)域權(quán)威期刊(如Journal of neuroscience, cerebral cortex, neuroimage等 )發(fā)表SCI論文多篇,相關(guān)研究工作得到了國內(nèi)外同行的廣泛關(guān)注和高度評價,發(fā)表論文已被SCI引用超過700次。獲批軟件著作權(quán)3項(如PANDA軟件),發(fā)明專利1項。 現(xiàn)任PLoS ONE學術(shù)編輯(academic editor),國家自然科學基金項目、中荷聯(lián)合科研主題(JSTP)項目評審專家,并擔任多個國際期刊審稿人,現(xiàn)承擔多項國家級科研項目(如國自然面上項目、科技部973(青年科學家項目)科研骨干、國家社科基金重大專項子課題負責人等)。
 
      夏明睿,博士,北京師范大學認知神經(jīng)科學與學習國家重點實驗室科研助理。主要研究方向為靜息態(tài)腦功能網(wǎng)絡(luò)的計算方法,及其在神經(jīng)精神疾病中的應(yīng)用,腦網(wǎng)絡(luò)可視化等。在國際期刊發(fā)表SCI論文數(shù)篇,編寫了腦網(wǎng)絡(luò)繪制軟件BrainNet Viewer,下載量達5000余次,用該軟件繪制圖片的期刊封面文章5篇。曾獲認知神經(jīng)科學與學習國家重點實驗室優(yōu)秀學術(shù)成果獎、教育部博士研究生學術(shù)新人獎等。
 
      3.    課程安排 
20131121日(晚上7:00開始):warmup course
  • Step-by-step processing and analysis of R-fMRI data (Mingrui Xia&Xinian Zuo)
 
20131122日(上午8:30開始):
  • R-fMRI: biophysical mechanisms of BOLD imaging (Anthony Liu)
  • R-fMRI: introduction of resting-state BOLD fMRI (Yufeng Zang)
  • Multi-modal integration: R-fMRI and perfusion MRI (Anthony  Liu)
  • R-fMRI: pre-processing steps and relevant considerations (Xinian Zuo)
  • R-fMRI: local activity --method and applications to brain disorders and memory consolidation (Yufeng Zang)
  • R-fMRI: seed-based connectivity analysis--methods and applications  (Mingrui Xia)
  • Panel discussion: R-fMRI technique—experimental design and data analysis
 
20131123日:(830)
  • R-fMRI: ICA-based connectivity analysis --methods and applications (Xinian Zuo)
  • R-fMRI: graph-based network analysis--methods and applications (Yong He)
  • R-fMRI: studying cognition (Yanchao Bi)
  • R-fMRI: studying neuropsychiatric disorders (Fei Wang)
  • Panel discussion: R-fMRI connectivity analysis and applications
  • Student: Oral presentation
 
20131124日(下午400結(jié)束):
  • Multi-modal integration: R-fMRI and diffusion MRI (Gaolang Gong)
  • R-fMRI packages: analysis and visualization tools (Mingrui Xia)
  • How to write R-fMRI papers (Yong He)
 
以上報告均以中文授課
4.    備注
¨        培訓費:每人3000元(提供“培訓費”正式發(fā)票),包括培訓費、資料費、餐費; 交通及住宿費用自理。
¨        培訓地點:北京市圓山大酒店(北京市西城區(qū)裕民路2號)。
¨        學員住宿地點:北京市圓山大酒店  標準雙人間:300元/間/天(150元/人/天)
¨        全體學員于2013年11月21日下午在北京市圓山大酒店大堂集中報到,21日晚
上19:00開始上課,22-24日全天培訓,課程于24日下午4時結(jié)束。
¨        最終課程安排以報到當日發(fā)放的課程表為準。
¨        報名方法:電話或電子郵件均可,最好以電話確認。
¨        培訓班限額招生,為便于會務(wù)安排,報名敬請從速。
¨        報名截至日期:2013年11月10日
為便于會務(wù)安排,報名敬請從速!
   北京報名點:
   聯(lián)系人:周丹 
           聯(lián)系電話: 13683079540
          Email: zhoudan@sinorad.com
 
    深圳報名點:
            聯(lián)系人:應(yīng)敏 
            聯(lián)系電話: 13632680220
            Email: yingmin@sinorad.com
 
 
交費方法:會議前銀行轉(zhuǎn)賬或現(xiàn)場交現(xiàn)金(現(xiàn)場不能刷卡)
如通過銀行匯款,請將學費匯至下列賬號(注明:2013北京fMRI培訓班):
戶 名:北京中科美德醫(yī)療信息科技有限公司
開戶行:中國建設(shè)銀行北京阜成路支行
賬 號:11001085400059610940
 
北京市圓山大酒店路線圖:
地址:北京市西城區(qū)裕民路2號
酒店聯(lián)系電話: 010-62023328,62010033
 
 



神經(jīng)影像分析軟件培訓計劃survey
常用軟件及功能列表
  功能 領(lǐng)域
子領(lǐng)域
軟件名稱
功能簡述
 興趣 指數(shù)*
DTI
 
DTI studio
DTI Studio是一個在Windows下運行的擴散張量圖像后處理程序。適合張量計算,顏色映射,白質(zhì)纖維束跟蹤,三維可視化等任務(wù)。
 
MedInria
MedINRIA是由法國INRIA開發(fā)的醫(yī)學影像后處理平臺。包含醫(yī)學影像可視化,DTI纖維束跟蹤與張量顯示,圖像配準,多硬化癥分析,腦溝回可視化等功能。
 
FSL
FSL偏重于DTI的統(tǒng)計學處理分析。
 
TBSS
TBSS是FSL軟件下的一個DTI數(shù)據(jù)處理工具,主要用于比較不同組人群之間局部FA或其他DTI參數(shù)的差異,與VBM或VBA比較相近,但所使用的算法完全不同,是目前DTI數(shù)據(jù)中比較常用的軟件之一。
 
TrackVis
TrackVis是一款多平臺DTI數(shù)據(jù)處理軟件,可以在Windows系統(tǒng)或Linux系統(tǒng)下使用,可用于計算計算纖維束走形和顯示非常方便的軟件。該軟件由兩個工具箱構(gòu)成,Diffusion Toolkit用于計算DTI或HARDI數(shù)據(jù)以及常用的各參數(shù),如ADC、FA、本征值等。TrackVis用于對計算出的神經(jīng)纖維束顯示和分析,可以手工畫ROI或VOI也可以通過導入ROI或VOI進行纖維束追蹤,并可分析通過ROI的纖維束數(shù)目及長度等信息。是目前比較好用的一款DTI數(shù)據(jù)處理軟件,上手比較容易。
 
腦結(jié)構(gòu)連接分析
PANDA
PANDA是基于FSL等軟件開發(fā)的dMRI數(shù)據(jù)處理軟件。它可以全自動地對大量的被試進行預處理,并產(chǎn)生用于voxel-based、atlas-based和TBSS-based統(tǒng)計分析所需的數(shù)據(jù);此外可以通過確定性追蹤和概率追蹤進行網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建。軟件可以同時并行分析大批量的數(shù)據(jù)。(www.nitrc.org/projects/panda/)
 
fMRI
靜息態(tài)fMRI
REST
REST是一個靜息態(tài)功能磁共振數(shù)據(jù)分析工具,可以計算功能連接(FC),區(qū)域同質(zhì)性(ReHo值),振幅低頻率波動(ALFF),Granger因果分析(GCA)等指標。同時包含豐富的圖像分析工具,如各種統(tǒng)計分析、可視化,多重比較校正,時間序列提取,結(jié)果出圖等。
 
FSL - MELODIC
FSL MELODIC 3.0是牛津大學開發(fā)的一個功能磁共振后處理軟件。該方法無需指定任何先驗模型,憑借獨立分量分析(ICA)將單個或多個四維數(shù)據(jù)集分解成不同的空間和時間組件,從而尋找活躍區(qū)域。
 
GIFT
基于Matlab的專門用來做ICA分析的工具包,可以用來進行基于任務(wù)fMRI和靜息fMRI的ICA分析及其后續(xù)分析。
 
MICA
基于Matlab的易于操作的ICA分析軟件??梢詫崿F(xiàn)較大樣本量數(shù)據(jù)的ICA分析,通過多次運算求得穩(wěn)定的ICA分析結(jié)果,克服ICA分析的不穩(wěn)定性。
 
DPARSF(A)
流水線式自動化的fMRI和靜息態(tài)fMRI數(shù)據(jù)預處理,靜息態(tài)fMRI數(shù)據(jù)后處理工具包??梢詫崿F(xiàn)目前主流的各種靜息態(tài)fMRI指標的計算??梢詫崿F(xiàn)并行的快速計算。
 
任務(wù)態(tài)fMRI
SPM
SPM是分析功能成像數(shù)據(jù)教主流的一個軟件包??梢苑治龆喾N腦成像數(shù)據(jù),包括fMRI,PET,SPECT,EEG和MEG。
 
GLM Flex
基于Matlab和SPM的二次統(tǒng)計(組分析)分析軟件,除了SPM包括的那些簡單模型(單樣本,雙樣本t檢驗等),還允許更多功能如mixed ANOVA,2×2被試內(nèi)設(shè)計,多于兩因素的ANOVA分析。
 
FSL-FEAT
FSL FEAT基于模型的fMRI數(shù)據(jù)分析軟件, FEAT對于實驗設(shè)計和分析具有很高的靈活性,適合于復雜的功能磁共振實驗設(shè)計任務(wù)。
 
AFNI
AFNI是在linux上運行的分析功能成像數(shù)據(jù)的工具集??梢苑治龆喾N腦成像數(shù)據(jù),包括fMRI,PET,SPECT等。
 
 
LISREL
LISREL (Linear Structural Relations)是由K.G. Joreskog & D. Sorbom所發(fā)展的結(jié)構(gòu)方程模型 (Structural Equation Modeling)軟件. LISREL被認為是最專業(yè)的結(jié)構(gòu)方程模塊(Structural Equation Modeling, 簡稱 SEM )分析工具,通過fMRI數(shù)據(jù)可以對大腦進行網(wǎng)絡(luò)模型構(gòu)建(帶有方向性),并對所做模型供驗證性因素分析。由于LISREL在探討多變項因果關(guān)系上的強力優(yōu)勢,最早LISREL運用于社會學研究,最近隨著腦科學研究的進展也有不少研究人員將結(jié)構(gòu)方程模型運用于大腦網(wǎng)絡(luò)的研究進而探討多變項或單變項之間的因果關(guān)系。
 
Structural MRI
皮層
Freesurfer
FreeSurfer是哈佛大學開發(fā)的磁共振神經(jīng)影像分析,主要用于測量大腦皮層的厚度和統(tǒng)計分析。
 
溝回
BrainVISA
BrainVISA 可以用來分析T1加權(quán)大腦MR圖像,包括灰/白質(zhì)分類,左右半球表面的提取與可視化,大腦皮質(zhì)溝回的提取、標記等。
 
結(jié)構(gòu)
SPM
測腦體積、VBM、及其他
 
多模態(tài)磁共振數(shù)據(jù)分析
腦網(wǎng)絡(luò)分析
GRETNA
GRETNA是一個針對磁共振影像數(shù)據(jù)開發(fā)的基于圖論的復雜腦網(wǎng)絡(luò)分析軟件。該軟件可以對腦功能影像進行自動預處理,并能批量計算常用的二值化或者加權(quán)腦網(wǎng)絡(luò)的拓撲屬性,如類聚系數(shù)、最短路徑長度、小世界屬性、網(wǎng)絡(luò)效率、模塊化、節(jié)點度、節(jié)點介數(shù)、節(jié)點效率等,并能對結(jié)果進行統(tǒng)計分析(www.nitrc.org/projects/gretna)
 
腦網(wǎng)絡(luò)可視化
BrainNet Viewer
BrainNet Viewer是一個腦網(wǎng)絡(luò)可視化軟件,提供了豐富的設(shè)置來幫助研究者快速、靈活、方便地展示腦連接網(wǎng)絡(luò)的信息。該軟件支持顯示基于圖論的三維腦網(wǎng)絡(luò)模型以及體數(shù)據(jù)到三維腦曲面的映射,并能夠?qū)@示結(jié)果保存成常用的圖片格式或制作展示電影動畫(www.nitrc.org/projects/bnv/)
 
多功能平臺
3D slicer
3D Slicer是一個開放式的醫(yī)學影像后處理平臺,可以創(chuàng)建特定主題的醫(yī)學圖像分析和可視化工具。包含
多種模態(tài)成像如MRI,CT,超聲,核醫(yī)學等,可以分析從頭部到腳的多個器官影像,具有較好的可擴展性。
 
 
FSL
測體積、VBM、及其他
 
 
*興趣指數(shù):1-5:  1=最不想學,5=最想學




 
第九屆功能磁共振影像(fMRI)
---靜息態(tài)fMRI技術(shù)及應(yīng)用專題培訓班(2013.11.21-24 中國?北京)
執(zhí)


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